Małgorzata Anna Mokrus zajmuje się działalnością badawczą łącząc w swych interpretacjach doświadczenie wykonawcze z analizą opartą na poszukiwaniu szerokich kontekstów kulturowych oraz artystycznych paraleli. Wielokrotnie zapraszana jako wykonawca i prelegent występowała w Polsce i za granicą podczas wykładów autorskich oraz konferencji naukowych, brała udział m.in. w:

• • • • VII Ogólnopolskiej Konferencji Naukowo-Artystycznej „Ko-respondencja. Na styku sztuk” (UMFC w Warszawie – Filia w Białymstoku)
      • Ogólnopolskiej Konferencji Naukowej „Chopin na Kujawach i Pomorzu” (Ośrodek Chopinowski w Szafarni wraz z Fundacją Chopin w Ogrodzie Sztuk)
      • VI Ogólnopolskiej Konferencji Naukowo-Artystycznej „Ko-respondencja. Na styku sztuk” (UMFC w Warszawie – Filia w Białymstoku)
      • Eight International Symposium of Music Pedagogues “Music Pedagogy in the Context of Present and Future Changes” (Sveučilište Jurja Dobrile u Puli, Chorwacja)
      • V Ogólnopolskiej Konferencji Naukowej „Ko-respondencja. Na styku sztuk” (UMFC w Warszawie – Filia w Białymstoku)
      • II Kongresie Młodej Nauki. Międzynarodowej i multidyscyplinarnej konferencji naukowej (Uniwersytet Gdański)
      • XIX Międzynarodowej Konferencji Naukowej „Muzyka fortepianowa” (Akademia Muzyczna im. Stanisława Moniuszki w Gdańsku)
      • V Ogólnopolskiej Konferencji Doktorantów Uczelni Muzycznych (UMFC w Warszawie), I Międzynarodowej Sesji Naukowej Katedry Kameralistyki „Styl klasyczny – próba definicji” (Akademia Muzyczna im. Karola Szymanowskiego w Katowicach).

W 2021 roku ukazała się monografia jej autorstwa Ilustracjonizm i symbolizm „Études-Tableaux” Sergiusza Rachmaninowa (Wydawnictwo Akademii Muzycznej im. Karola Szymanowskiego w Katowicach), zawierająca płytę z rejestracją fonograficzną kompletu Études-Tableaux w jej interpretacji. Jest także autorką artykułów naukowych publikowanych w tomach: Glazbena pedagogija u svjetlu sadašnjih i budućih promjena 8 / Pedagogy in the Context of Present and Future Changes (Sveučilište Jurja Dobrile u Puli, Chorwacja 2023), Muzyka fortepianowa / Piano Music XVII (Wydawnictwo Akademii Muzycznej im. Stanisława Moniuszki w Gdańsku, 2023), Muzyczne Aliaże (Chopin University Press, Białystok–Warszawa 2024), Fryderyka Chopina światy dalekie i bliskie (Bernardinum, Pelplin 2025).